Τα φαράγγια του νομού Χανίων είναι κατάφυτα και χαρακτηρίζονται από μια άγρια ομορφιά. Ανάμεσα τους και το πιο διάσημο φαράγγι της Κρήτης, το φαράγγι της Σαμαριάς όπου βρίσκει καταφύγιο οΚρητικός Αίγαγρος (γνωστός και ως Κρι-Κρι).
Συνήθως καταλήγουν σε πανέμορφες παραλίες και αποτελούν μοναδικά οικοσυστήματα με ενδημικά είδη φυτών και σπάνια αρπακτικά πτηνά.